簡単に出来ます。

添付にサンプル付けてます。
「スライダ」をモーションブラウザで操作すればアニメーションに出来ます。
回転ジョイントは円柱固定用なんで、ジョイントなら何でもＯＫです。

SO20130515.shd

いろいろやり方はあると思うけど、思いつくのはこんなのです。
1.円柱を作成
2.円柱が、収まる立方体縦に2つならべる
3.それぞれの表面材質に違う色を設定し、演算子"="をつける
4.2つの立方体をぴったりくっつけた状態で、上から下に動くアニメを作成

色が変化する動画を作成して
その動画をテクスチャマッピングとして使用する
くらいしかできなそうです。

【曲がった円柱の色の変化のアニメーションを作るところで苦戦しています。】

（詳細）
曲がった円柱の上面から底面に向かって色が付き始め、最終的には円柱全体の色が変化するようにしたいです。
一気に全体の色が変わるものではなく一方向からしだいに色がつく変化です。
Shadeのヘルプ・Manual・ネットで探してみたのですが方法がわかりません。
どなたかお願いします。