方策尽きて、フォーラムに投稿すると、何故か新たな対策案を思いつくもので、チャレンジしたところ解決しました。
どうやら、bjam の実行は、x64クロスコマンドプロンプトでないといけないだけと早とちりし、
元々持っていた、.net2005のクロスプロンプト上で行ったのがいけなかったようです。
VisualC++2010expressには、クロスプロンプトがないので横着して、
--toolset=msve-10.0
と指定さえすれば大丈夫と思い込んだのが間違いだったようです。
ネット検索で、express版のx64クロスコマンドプロンプトを実現する、裏技を見つけ、
それで、もう一度０から全手順をやり直したら、リンクエラーなしで、boostが利用可能になりした。

ようやく、SDK12でプラグインを作り始めたところBoostのリンクでリンクエラーになってしまいました。
32ビット版は、リンクできるのですが、64ビット版は、以下のようなリンクエラーが出ます。
色々ネット検索してみましたが、結構引っかかるものの、解決策までいたりません。
作ったlibと2010expressの処理系が異なる場合も考えられますが、
bjam で、
bjam --toolset=msvc-10.0 address-model=64 --build-type=complete stage
と意識して、2010のvc++を指定して作ったつもりです。
(PC内には、2005も同居しています。)
boost の版は、49_0 でビルドしました。32ビット版も
bjam --toolset=msvc-10.0 --build-type=complete stage
で作りこちらは、ちゃんとリンクできました。
もし、解決案があれば、お教えください。

1>libboost_filesystem-vc100-mt-gd-1_49.lib(operations.obj) : error LNK2019: unresolved external symbol "__declspec(dllimport) public: __cdecl std::_Container_base::_Container_base(void)" (__imp_??0_Container_base@std@@QEAA@XZ) referenced in function "protected: __cdecl std::_Vector_val >::_Vector_val >(class std::allocator)" (??0?$_Vector_val@_WV?$allocator@_W@std@@@std@@IEAA@V?$allocator@_W@1@@Z)